质粒图谱为什么有两个方向?
质粒图谱上,剪头有两个方向,有的箭头顺时针方向,有的箭头逆时针方向。原因是这是代表两条 DNA 链,即质粒是环状双链 DNA,它的启动子等在其中一条链上,而它的某些基因在另一条链上。
延伸阅读
碱裂解法提取质粒DNA的电泳图谱,为何我的只有两条带?分别都是什么?
1)选择分子量 跟你的质粒接近的marker,最理想的是包含质粒分子量在内,但据我所知没有这样的marker。
2)你这个电泳图上样量太大了,一方面条带不整齐难以判断,另一方面你干嘛要纠结于几条带呢?一般说是3条带也是理论上的,但实际上,在菌体内复制的质粒就是一个连续的状态,什么样都有,电泳结果就可能造成条带的局部涂布。所谓的三条带解释没有定论,现在一般认为是超螺旋、复制型(处于复制的半开环状态,即眼结构)和开环DNA(一条链断了),早先认为的 线状DNA后来被否,因为质粒很不容易断裂成线状的。顺序应该是超螺旋在最前边,开环在后边。凭经验,我估计你的超螺旋和复制型合并成你那个粗的涂抹带了,后边那个细的是少量的开环DNA。
为什么质粒图谱上标了启动子没有终止子?
质粒图谱上的序列没有终止子,只需要poly a来终止即可。